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OPeNDAP

Outline †

海洋や気象を対象に，気温や風速など様々な科学データをネットワーク上で相互利用するインターネットプロトコル． Open-source Project for a Network Data Access Protocolのアクロニウム． Netcdfが使える環境であることが必要．

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OPeNDAP for Matlab †

必要なファイル

一般
- loaddap (matlab2009a,bでは動かない)
Linuxのみ
- libdap and libxml2 library

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Toolbox †

Matlab用のloaddap
- The Matlab Structs Tool
Matlab用のOPeNDAP
- Matlab OPeNDAP Ocean Toolbox
OPeNDAP GUI
- DapperM - A Matlab interface to Dapper

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Install †

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Linux †

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loaddap †

require
- libcurl
- libxml2 (Ubuntuのlibxml-*-devのパッケージを利用)

Install libcurl

./configure
make
make test
> 最後の方にテストの結果が表示される
> TESTDONE: 428 tests out of 428 reported OK: 100%
> TESTDONE: 543 tests were considered during 212 seconds.
make install

Install libdap

./configure
make
make check (optional, DejaGNU is required)
make install

loaddap (R2008bで動作確認, 2009a,bは×)

./configure --prefix=/usr/local/loaddap
make
make install

Matlab OPeNDAP Ocean Toolbox
- unzipして，matlabのpathを通すだけ
DapperM - A Matlab interface to Dapper
- 適当な場所にDapperMのdirectoryをおく．
- $matlabroot/toolbox/local/classpath.txtを編集する．
  - $matlabroot/toolbox/DapperM/DapperM.jar
- DapperM/dappermdpr_imports.mを編集
  - System.setProperty('ndedit.support.dir','/Applications/MATLAB73/toolbox/DapperM/NdEdit_Support');
- matlabにDapperM/dapperm のパスを通す
- 確認
  - dpr_gui" to open the DapperM

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Windows †

The Matlab Structs ToolとMatlab OPeNDAP Ocean Toolboxをダウンロードしてインストールする．
C:\opendap\bin, C:\opendap\dll等にパスを通す（デフォルトインストールだとかってにパスが通っている）
C:\opendap\loaddapをMATLABのpathに追加これで終わり

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インストール後のテスト †

テストコマンド

x = loaddap('-A', 'http://test.opendap.org/opendap/data/nc/coads_climatology.nc')

正常なリターン

x = 
                 SST: [1x1 struct]
                AIRT: [1x1 struct]
                UWND: [1x1 struct]
                VWND: [1x1 struct]
   Global_Attributes: [1x1 struct]

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Trouble shooting †

以下のようなエラーが出る場合がある．

/usr/local/bin/writedap: /usr/local/matlab_2008b/sys/os/glnxa64/libstdc++.so.6: version `GLIBCXX_3.4.9' not found (required by /usr/local/bin/writedap)